Em 1987 o NUTEP iniciou suas atividades atendendo bebês prematuros procedentes da Maternidade Escola Assis Chateaubriand – MEAC-UFC. Aos poucos foi ampliando sua atuação junto à comunidade, atendendo hoje, a faixa etária de 0 a 12 anos, com uma equipe multidisciplinar de cerca de 90 profissionais, trabalhando diretamente com cerca de 1.000 crianças e suas famílias, seguindo protocolos clínicos de aceitação universal.
O NUTEP presta assistência em três unidades: a Sede no ambulatório de pediatria da UFC, a Unidade II com o serviço de assistência a crianças com Transtornos do Espectro Autista – TEA e a Unidade III onde funciona o serviço de Tecnologia Assistiva.